Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA9P31269 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms