Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CD40LGP29965 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CD40LGP29965 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CD40LGP29965 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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