Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GTF2E1P29083 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms