Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GCAP28676 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GCAP28676 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GCAP28676 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GCAP28676 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms