Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
POLD1P28340 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
POLD1P28340 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POLD1P28340 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms