Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HLA-DMAP28067 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
HLA-DMAP28067 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms