Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMA4P25789 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms