Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTSSP25774 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTSSP25774 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CTSSP25774 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CTSSP25774 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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