Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
APCP25054 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
APCP25054 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
APCP25054 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
APCP25054 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
APCP25054 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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