Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
SPRR1BP22528 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms