Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LMNB1P20700 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms