Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMB1P20618 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMB1P20618 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PSMB1P20618 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms