Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATF3P18847 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATF3P18847 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATF3P18847 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATF3P18847 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms