Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EPCAMP16422 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms