Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DSPP15924 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DSPP15924 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DSPP15924 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms