Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NME1P15531 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NME1P15531 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NME1P15531 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NME1P15531 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms