Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GABRA1P14867 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GABRA1P14867 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms