Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA4P13612 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms