Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HOXD8P13378 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXD8P13378 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms