Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMC1P11047 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms