Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLUP10909 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLUP10909 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLUP10909 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms