Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PGA3P0DJD8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms