Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RGPD2P0DJD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RGPD2P0DJD1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms