Protein–RNA interactions for Protein: P0CV99

TSPY4, Testis-specific Y-encoded protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPY4P0CV99 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TSPY4P0CV99 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms