Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PKHD1P08F94 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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