Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERPIND1P05546 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms