Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSTAP01040 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSTAP01040 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms