Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ATG7O95352 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ATG7O95352 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ATG7O95352 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATG7O95352 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms