Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DCTN3O75935 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms