Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DYNC1LI2O43237 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms