Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PLXNB1O43157 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms