Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLOCKO15516 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms