Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNPHO15079 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNPHO15079 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNPHO15079 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC253576.1-201ENST00000511645 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNPHO15079 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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