Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYNMO15061 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYNMO15061 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SYNMO15061 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYNMO15061 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms