Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CROCC2H7BZ55 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CROCC2H7BZ55 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms