Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARID3CA6NKF2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARID3CA6NKF2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms