Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD8B2A6NJW9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms