Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC160A6NGH7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms