Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MAP3K4Q9Y6R4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MAP3K4Q9Y6R4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms