Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD54L2Q9Y4B4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms