Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMED7Q9Y3B3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms