Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHF11Q9UIL8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms