Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEFF2Q9UIK5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms