Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
USP25Q9UHP3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP25Q9UHP3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms