Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF2IRD1Q9UHL9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms