Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL13Q9P2N7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL13Q9P2N7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms