Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4Q9P0V3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4Q9P0V3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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