Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASCL3Q9NQ33 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASCL3Q9NQ33 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms