Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR4Q9NPB9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR4Q9NPB9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACKR4Q9NPB9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACKR4Q9NPB9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms