Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NRDE2Q9H7Z3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms